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台湾少子化现象逐年加剧，陆续有大专院校招生状况不佳被迫退场，近年教育部积极鼓励大学合并，已有部分大学采行。今（22）日真理大学校长林文昌也说，近期已与同为长老教会体系下的真理大学、马偕医学院、马偕护专三校进行资源整合、结盟，争取三年内完成合并。
真理大学、马偕医学院、马偕护专皆由台湾长老教会创办，目前马偕医学院与马偕护专为同一董事会，真理大学为另一董事会，但真理大学校方已有打算在今年更名为马偕大学，目前三校也已先从图书共享、共开课程等校际资源进行整合，并开始准备合并程序。未来三校合并后将有四大校区，分别为：真理大学淡水、麻豆校区，马偕医学院三芝校区，以及马偕护专关渡校区。
其中真理大学麻豆校区因招生状况不理想，几年前已有多个校系北移，林文昌表示，未来麻豆校区也不再有大学部学生，预计将该校区作为研究发展中心，合并后将结合台南麻豆新楼医院发展更优良的产学合作。对于三校合并，林文昌态度乐观，认为合并后马偕医学院与马偕护专将会由单科学校转型成实力坚强的综合型大学，并有更丰富多元的教学资源。他也说，相信只要三校都同意合并，教育部也会尊重其决定。