南宋（1127年6月12日—1279年3月19日）是中国宋朝的其中一个时期。
其中
1276年2月4日（至元十三年正月十八）元军攻破南宋都城临安（今杭州），俘5岁的南宋
皇帝恭帝，南宋大势已去。
之后南宋残余势力陆秀夫、文天祥和张世杰等人连续拥立了两个幼小皇帝（端宗、末帝）
，成立小朝廷，直到末帝跳海为止南宋灭亡。
1644年，李自成所建立的大顺军攻破北京，思宗自缢于煤山，明朝灭亡。
之后
南明（1644年－1662年）是明朝灭亡后，其皇族与官员在中国南方建立的若干政权的统称
，为时十八年。
总共历经安宗弘光帝、绍宗隆武帝、文宗绍武帝、昭宗永历帝四位皇帝，直到昭宗永历帝
被吴三桂派人绞杀为止南明灭亡。
所以说南宋被元军攻破首都掳走皇帝不叫灭亡，之后往南方逃的两位小皇帝能被认为宋朝
正统
反而明朝被攻破首都皇帝自杀叫做灭亡，之后在南方的四位南明皇帝不被认为是明朝正统
这差别到底在哪里？

宋端宗与祥兴帝都是度宗的直系后裔南明四帝与崇祯帝的关系来说算是宗室也许因此就分出了亲疏/正统与否的分别

史家大概无法称一个朝代为南南宋吧XD

南明那几个互不承认对方为正统阿，一明各表的概念，宋末至少汉人有共识承认某位是正统。 像是魏晋南北朝北魏也是皇室分裂出两支后，就各改叫西魏东魏了

清朝是承继明朝的正统﹐所以顺治入关到北京﹐就又举行了一次在北京的登基即皇帝位仪式﹐将清、明两统一并继承（类似于兼祧）﹐既然明朝这条正统线已经被顺治继承（以替崇祯报仇的旗号）﹐那么其他的南明当然就不是明的正统的延续了（包括明郑）。而元朝并不继承宋朝的正统﹐忽必烈虽然也兼祧蒙古汗位与中国皇位﹐但他是延续金这条线（金又是辽宋两线合并）﹐所以对忽必烈来说﹐南宋的存亡并不影响他的正统性﹐所以将南宋小皇帝视为南宋正统线的延续并无问题﹐反正不管延到何时﹐都是被忽必烈自己的中原一统线挤掉。

借问，清朝写明史似乎是以弘光做结束(1645年)为何现在都以1644做结束?

楼上这个问题我也很好奇

因为大明崇祯17年(1644)，皇上在媒山歪脖树自缢身亡。

清朝写明史以弘光结束？

是国榷与通鉴辑览以弘光被俘作为明朝结束的指标