除了气候、当时日本的农业技术力各地也不相同
镰仓时代日本才开始二毛作、室町时期推广到関东。
应永２６（１４１９）年李氏朝鲜曾因倭寇问题进攻对马，后续的外交处理朝鲜派人与
室町幕府交涉有留下近畿行【三毛作】的记录。当时的関东应该还停留在二毛作、越后
应与関东相仿。
三毛作一般认为是米＞麦＞荞麦（杂粮、大豆等）
西日本的技术力一向比东日本要先近，因为总是先接触外来文化。
且安定性也有差别、朝仓氏在越前百余年经营。开发度与人口不是偏远、战乱的越后能
比。

他说的加贺百万石，不包括越前吧 （因为你忽然题越前）

加贺从1488年开始就被本愿寺统治,到织田军入侵前,内部应该也没发生什么大动乱,石高比较高似乎蛮正常的?

加贺还是有战事的，朝仓家也打进去过很多次

大家讲了这么多，还是没回答到原po的疑问