一、车祸发生日期：
(刑法告诉期为半年，民事请求权时效为两年)
已提出过失伤害告诉
二、当下双方是否有人受伤，有无验伤：
当下没有进行验伤,事后有去看医生,医生有开诊断证明
三、当下是否有报警、做笔录、现场是否被破坏：
有报警也有笔录,现场未被破坏
四、双方是否有保险、有无联络保险公司：
(强制责任险不赔驾驶，只赔乘客跟对方驾驶或其他第三人)
有保险,但由于车子折旧问题保险只愿赔偿2万(原厂估算修车费用23万)
五、事实经过：
(请说明过程、路权、双方行驶道路大小、有无路口、号志、车速、控告情况、有无证
人、车辆撞击点、是否变换车道、车辆停止的话停车位置为何)
我方为停止等红绿灯的情况下,无故遭对方从后方追撞
六、问题：
发生时间为去年9月,于2月提出过失伤害告诉,目前接获法院发文如下:
主旨:请尽速鉴定肇事原因,并将鉴定结果,送院参考.
说明:
一. 本院受理XXX过失伤害案件关于104年O月O日OO时OO分在XXXXX处肇事,
其肇事原因如何?双方过失责任如何?亟待明了.
我的问题是我查到的交通事故鉴定申请方式
(1)已进入司法程序者(已提出告诉):请将您的疑义写出,并向[司法机关]声请鉴定.
(2)未进入司法程序者(未提出告诉):XXXXXXX.....略
所谓的疑义是指什么?要向哪个司法机关声请鉴定?
有点让人摸不著头绪,有没有人有经验可以详细告知一下呢?
先感谢各位帮 小弟/小妹 解惑或提出建议，如内容尚有不足，盼请提出需补充之处。