各位法律先进大家好，我最近面临到一些问题想请教。
我阿公阿嬷育有三男二女。
去年阿公先过世，之后我爸过世，当时阿公的遗产在全体同意后，都过户给我阿嬷。今年阿嬷也过世了，遗留了一栋祖厝一块农地，祖厝的地和邻居共有，此建筑其中一部分是违建。农地为独立产权，但是可建面积已经并到祖厝，所以不能兴建建筑（这点待查）。
目前还在讨论怎么分财产的阶段。由于我和我妹都在外地发展，不可能回去使用祖厝，所以我和我妹的持分会交由我弟使用。讨论的时候是把我弟当我爸在讨论。
目前倾向农地归两位姑姑，祖厝加建地归两位叔叔和我弟公同共有这个方案。
因为我弟想将祖厝的三分之一（大概是违建的区域）整修居住，想请问：
1. 要怎么样能保障居住？需要和其他共有人订租赁契约吗？如果有租赁契约，是否整修费用其他共有人也要分担？
2. 如果此违建遭检举，会面临被要求搬迁和拆除吗？是否能要求搬迁费？需要先分割才能拆除吗？
3. 由于农地可建面积已经申请了，盖在祖厝的土地上，假使农地分给两位姑姑，他们能要求拿回农舍可建造的面积吗？
4. 请问这种分配方式是协议分割书写清楚，办理过户就可以了吗？
感谢各位的回答