关于司马芳与司马防，履历证据看来很像是同一人。
到了晋世确实完全没必要再避芳字，
那么没道理说碑上写芳反而一堆文献却都用防。
尤其早期的避讳常用的手法不是近音反而是近义，芳换防没啥意思吧。
我个人的看法是，或许只能诉诸早期某些书写的不规范。
（尤其是同/近音字）
这种近音字的书写不规范在南北朝史料似乎也偶或可见。
但碑上所记是字文豫，史传所载却是字建公。
“建公”感觉上比较可以与“防”互训？
至于同音字避不避，答案是，那个时期还是得避的。
司马昭与钟会互相开父讳的玩笑：
司马昭：“与人期行，何以迟迟？望卿遥遥不至。”
会答曰：“矫然懿实，何必同羣。”
（《世说‧排调》第二十五）
这里“遥”只是钟会父钟繇的同音字，仍然算是触讳的。
（但因为他们是很熟的狎友，所以开这玩笑只算排调，
卢志与陆机陆云不熟，
却直接开口就问陆机“陆逊、陆抗是君何物”那是很不礼貌了。
所以陆机抗言答辩算是方正。）
那么为什么司马懿的曾孙就直接叫司马乂？似乎同音不避？
简单说是因为，今音相混但古音不同而已。
古音
https://ytenx.org/zim?dzih=%E6%87%BF&dzyen=1&jtkb=1&jtkd=1&jtdt=1&jtgt=1
https://ytenx.org/zim?dzih=%E4%B9%82&dzyen=1&jtkb=1&jtkd=1&jtdt=1&jtgt=1
所以你查日文维基会发现
司马懿叫做しばい
司马乂却叫做しばがい
（还有乂亦与义本不同音，虽稍近。）
至于几代后可以不避？
应该是除了不祧之祖或者某支的始祖外，一般而言是五世而迁？
其实在上古来说这也差不多就是一个人真正能见过能有感情的祖上吧。
当然后代制度更复杂那是另一回事了。