[前言]
因为药学背景出国唸书的资料实在不多（且药学系底下实在可以有太多分支），再加上之
前从来没有看到有人分享过瑞典Uppsala pharmaceutical modelling的任何心得文，所有
东西真的是努力和很多人询问＋自己体验而来，正逢自己刚毕业记忆犹新，希望经验分享
可以提供给有兴趣出国读书的药学人一些资讯！发在facebook所以如果有朋友想转发给同
系同学或学弟妹也欢迎！之前已经有贴一篇录取心得文在ptt所以在留学版可以搜到，有
什么问题也欢迎联系我～以下的内容除了我以外，还有加入比我晚一年来念的台湾朋友的
一些心得（希望这样比较不偏颇一点XD）
基本上这个系是纯dry lab，设计给对于使用“computational modelling techniques”
有兴趣的人来念。大部分的人背景是药学系(pharmacy or pharmaceutical science)，我
们这年和下一年的大约有2-3成biomedicine, bioengineering, chemistry, biology,
medicine background。这个系的大部分修课都已经排好（除了第三学期可以选修2门或选
择直接做论文），然后跟台湾的硕班很不一样的部分是，这个系是1个月只上一门的密集
式课程（每天都上同一门课的东西，然后1个月的评量通常是期末报告/期末考这样），全
部的课修完才会开始做硕班论文。
Medium图文好读版：
https://reurl.cc/zYEel0
Program资讯和课纲参考：
https://reurl.cc/VLlEzA
[个人背景]
National Taiwan University Pharm. D.
Some experience in population pharmacokinetic (popPK) modelling (2 projects)
No background in programming
[课程介绍]
Semester 1
Drug discovery and development
主要形式：
lecture、workshop和报告（小组书面及口头报告）
课程内容：
Module 1: drug discovery “screening hits -> find lead compounds -> select
potential candidates”
Module 2: drug development “pharmaceutical development”
Module 3: drug development “clinical development plan” - focusing on
distinct parts of the clinical development process
心得：
基本上是一堂内容很广泛的入门课，有药学背景的不会觉得内容过于困难，个人觉得在大
学期间没有修到很多和drug discovery相关的课程所以也算有学习到新知。Module 3是在
两周内要跟组员一起设计phase I first-in-human (FIH) single ascending dose
(SAD) study一直到phase III的剂量、收案人数、go/no-go criteria等，可以实际知道
clinical trial design的过程，我觉得很有趣！
Molecular biopharmaceutics
主要形式：
lecture、workshop和个人口头报告
课程内容：
Module 1: physiology (GI, liver and CNS)
Module 2: oral drug absorption and bioavailability (solubility, permeability
and dissolution)
Module 3: transporters, basic PK, introductory PBPK modeling
心得：
主要和biopharmaceutics相关的课程，整个课程组织很有系统！lecture多、workshop的
阅读量也大，这门课最后有个个人10分钟seminar（报洭pponent Q&A时间）算是刚来
这边念硕班的挑战之一？还有1-2天的PK-sim (PBPK modeling software) workshop，算
是给对于这方面有兴趣的人一个尝试！
Introduction to Programming in Python and R for Bioscience
主要形式：
上午lecture、下午lab，有两个期末报]一个Python一个R）
课程内容：
Module 1: Python
Module 2: R
心得：
后来跟同学们聊天的时候，大家公认这门课为本系最痛苦课程（之一）。因为这个硕班科
系在写论文时会有4个group可以选，有的要会使用Python有的要会使用R，所以这门课的
目的就是让大家具备基本programming技能。由于这门课前两周是Python后两周是R，如果
是完全的程式新手真的会想撞墙（从第一天print hello world到第二周直接要写一个
Python final project），我身边不知道有多少同学因为这门课想休学XD。强烈建议大家
身边要有愿意被烦被询问的写程式高手（像我身边哈哈哈），虽然程式还是得自己写但是
会有非常非常大的帮助！后两周R的部分反而因为负责的老师上得很好＋lab exercises都
很详尽很清楚，再加上老师和助教都很有帮助（就不说Python的老师了以及没有助教的部
分^^），所以按部就班就可以顺利完成R final project。我的感觉是这个系开始做论文
以后后面不管选哪个组都会用到programming技能（本人选pharmacometrics组，R用得世
界多），所以真的可以好好学一下！
Preclinical and clinical data analysis
主要形式：
lecture、lab exercises、讨论paper的seminar、团体口头＋个人书面报告
课程内容：
Module 1: statistical methodology, regression, model fitting
Module 2: machine learning
心得：
前两周的课程在复习过去的基本统计知识(t-test, ANOVA)以及
linear/non-linear/logistic regression以及新的optimal design，老师上得很有系统
！搭配computer lab exercises可以知道如何应用R去做统计。后两周主要是machine
learning的基本概念（clustering, supervised/unsupervised learning, model
evaluation），虽然本人完全没有这方面的background但老师上课讲得非常清楚，是个很
好的入门！最后的final project有两个（分别是R/python），就是应用前面学习的知识
做，是个让人受益良多的课。
Semester 2
Pharmaceutical Bioinformatics with Sequence Analysis
主要形式：
上午lecture、下午lab exercises、个人书面报告
课程内容：
（实在太包罗万象我只好罗列有上的topic）
Cheminformatics, basic Python, SQL, machine learning (supervised/unsupervised
learning), deep learning (neural network), next generation sequencing (NGS)
心得：
modelling program的同学都一致认为这门课的目标不明，因为内容很杂很混乱、有些内
容在第一学期已经修过，新的内容又教得不深入所以很难实际应用。个人觉得deep
learning的部分很有趣（也有一个lab exercise让你实际使用Python做neural network）
，但针对bioinformatics的部分我真的没有学到很多东西，有点可惜。
Computational Medicinal Chemistry
Advanced Molecular Modelling Applied to Drug Discovery
（实在不知道怎么分，干脆一起写）
主要形式：
lecture和lab exercises穿插
课程内容：
small molecule modelling, multivariate analysis, protein modelling and
docking, 3D-QSAR
Protein-ligand interactions, chemoinformatics, molecular dynamics, quantum
chemistry
心得：
药物化学相关的两门课，主要使用Maestro这个软件作molecule interaction,
modelling and docking（这个软件可以visualization、可以做hits screening等）。也
有使用一些machine learning学习到的技能做multivariate analysis。然后本人真的愚
笨无知，完全不知道这些物理化学到底在干嘛（quantum chemistry真的是beyond my
knowledge），但是我猜对化学有兴趣的人会觉得很有趣，因为可以真正的用电脑软件模
拟分子间的移动和结合！只是内容真的太硬，我最后也不知道怎么考过这两门课的^^
Clinical Pharmacokinetics and Pharmacodynamics
主要形式：
lecture和workshop穿插、最后两周是整天workshop
课程内容：
basic PK/PD and effect delay, disease progression, clinical trial simulation,
model-informed precision dosing, clinical study design & analysis
心得：
如果是喜欢pharmacokinetics (PK)的朋友，非、常、大、推、这、门、课！这门课从一
开始介绍了基本的PK/PD知识、effect delay的几个假设，到disease progression
modeling、在workshop实际让学生操作dose simulation或individual dosing等等。
必须特别提最后的两周密集式workshop是大家要design 从phase I to phase III
clinical trial，然后老师依据大家设计的人数、抽血时间点和inclusion criteria模拟
出数据，再让大家分析数据＋借由数据继续设计下一期的临床试验。整个两周就是应用第
一学期学习的clinical trial design知识＋PK/PD知识＋个人的统计能力做分析（我们这
年是很多人用R，但下一年的时候老师们就设计了一个excel让大家直接把数字填进去算好
），过程中都是同学们组内和组间的讨论，老师会在大家讨论时给大家指引和回答问题。
这个workshop真的超级酷，因为前面设计不好就可能完全看不到效果（或者是有人死掉）
然后影响后面的设计，让人真的有在两周内参与临床试验设计的感觉。
最后总结一下这门课，只能说整门课都非常硬（几乎每两三天就要口头报告/交书面报告
，最后两周整天的workshop几乎就是疯狂讨论＋当天报告，进度非常紧凑）但真的非常非
常好玩也非常棒！然后老师人也超好超可爱，强推！！！
Semester 3+4
Molecular Physical Pharmacy
主要形式：
lecture + homework
课程内容：
Module 1: self-assembly of amphiphilic molecules
Module 2: macromolecules, biopolymers and gels
Module 3: transport and release of drug molecules
Module 4: physics-based modelling
Module 5: scattering techniques
心得：
就是物理化学。很抱歉我真的没有太多的comment在这门课上，因为课程整个非常的数学+
物理，且很多时候老师会在课堂上导微积分给我们看但我们真的不知道目的为何，还有课
没上完叫大家回去自己看最后还考出来的（赞赞）。总之大部分的老师都教得让我不知如
何把这样的知识应用在modelling work上，然后考试真的超级难（六小时open-book，有
写作业分数先加20分，最后班上还是很多人被当）请大家自求多福^^
Models for Biological Systems
主要形式：
早上lecture、下午lab exercises，共两个project work
课程内容：
introduction of modelling and simulation, ordinary differential equations
(ODE), models for drug effect/nonlinear PK/drug absorption delay…,
NONMEM-related courses
心得：
这门课是系上的pharmacometrics课程，从最一开始的PK/PD modelling原理教起，到后面
实际操作NONMEM (PK/PD modelling software)、differential equations以及
variability等系统性学习。第一个project work是使用Berkeley Madonna做PK/PD
modelling，第二个project work则是使用NONMEM做PK/PD modelling，后者仍属于
pharmacometrics领域的gold standard software。根据没有任何这方面经验的同学表示
，这门课也是很难修，因为概念带得很快、也不太确定实际上到底怎么应用建模。个人觉
得课程讲义蛮系统化教学，但可能要精熟NONMEM只透过一门课还是很困难，但这门课可以
让学生知道何谓PK/PD modelling跟实际上如何应用在药物开发或临床情境，我觉得非常
有趣！
Elective courses (15 ECTS) + degree project/thesis (30 ECTS)
or
Degree project/thesis (45 ECTS)
主要形式：第三学期可以自选2门选修课，这样论文就是第四学期开始写（1月中-6月初）
。另一种就是直接从第三学期的后半写到第四学期结束（11月初-6月初）。第二学期的4
月中旬会让大家选择意愿也会公布可以选修的课，以过去经验，系上大部分的人都会选择
45学分的论文（因为可以做的研究时间比较长），但还是看有没有有兴趣的选修课＋时间
有没有冲堂比较重要！另外要注意的是，如果想选不在名单上的选修课作为毕业学分，事
先要先和系上的负责老师讨论过才行。
选组：系上的thesis project可以在四个组里选择：bioinformatics, computational
medicinal chemistry, biopharmaceutics (including PBPK modelling),
pharmacometrics。我这一年是在4月中旬的时候学校发网络表单，让大家填写自己选组的
preference，然后学校会（不知道依照什么标准）将大家分发到各个组，是的听起来非常
的神奇。所以强烈建议大家在修课期间就积极探索自己对哪个组和哪些老师的研究主题比
较有兴趣，在填写表单前就先联系有兴趣的老师，通常老师们都很愿意跟学生small talk
，也会告诉你他们手上现在有什么研究主题可以分配给硕班学生做的。如果先跟老师谈好
，到时候在填表单时只需要注明：已和某某老师谈好，到时候就会确保自己做这个项目。
心得：我是选45学分的thesis project in pharmacometrics，所以是从11月开始的。主
要的deadline有最一开始要先写一个project plan（11月底）、报告期中进度half-time
presentation（2月中）以及论文报告缴交和口试（5月底-6月初）。关于Uppsala
pharmacometrics组可以分享的真的很多，如果有兴趣且有特定问题想问的人可以在私我
，这里就不多赘述。总结而言老师们都非常好，组内的学术环境也很活跃，我个人大推！
[总结]
最后小小总结一下，我觉得在这个系里学到很多在台湾从来没有接触过的知识（主要是
modelling的部分），大部分的老师都非常认真友善，唯二我觉得没那么好的只有系上的
行政助理（有时候搞不太清楚状况），以及系上同学真的有很多来躺分还很不要脸的^^（
但我这年的比例比较高，下一年比例似乎就没那么高，所以还是运气成分居多）。只能说
瑞典（甚至是Uppsala）在台湾是个小众选择，但也可能只是因为资讯量不足导致。希望
借由这样的经验分享能带给药学人对于不同领域有更多的理解！这篇心得文真的很长很长
，感谢拜读的所有人～～