指 挥 官 陈 时 中 卫生福利部部长
副指挥官 陈 宗 彦 内政部次长
发 言 人 庄 人 祥 疾管署副署长
专家咨询小组
召集人 张上淳 台大副校长兼台北区网指挥官
医疗应变组
组 长 薛瑞元 卫生福利部次长
副组长 王必胜 医福会执行长
副组长 罗一钧 疾管署副署长
副组长 石崇良 医事司长
副组长 李伯璋 健保署署长
疫情监测组
组 长 周志浩 疾管署署长
副组长 谷瑞生 外交部研究设计委员会主任
副组长 刘定萍 疾管署疫情中心主任
边境检疫组
组 长 陈宗彦 内政部次长
副组长 钟景琨 移民署副署长
副组长 何丽莉 疾管署检疫组长
副组长 蔡志儒 陆委会法政处长
社区防疫组
组 长 何启功 卫生福利部政务次长
副组长 庄人祥 疾管署副署长
副组长 王英伟 国健署署长
副组长 林清淇 内政部民政司长
物资组
组 长 王美花 经济部政务次长
副组长 陈佩利 经济部工业局主秘
副组长 蔡寿洤 卫福部秘书处长
资讯组
组 长 简宏伟 行政院资安处处长
副组长 庞一鸣 卫福部资讯处处长
研发组
组 长 梁赓义 国卫院院长
副组长 吴秀梅 食药署署长
副组长 某个中央研究院代表
行政组
组 长 郑舜平 卫福部主秘
副组长 邓如秀 疾管署主秘
新闻宣导组
组 长 高 遵 行政院新传处长
副组长 曹凯玲 疾管署公关室主任
法务组*
组 长 陈明堂 法务部次长
副组长 钟瑞兰 法务部法律事务司司长
*法务组4/14增设，4/17网友大大来信更正名单
( 所以猜测副组长跟着搬移 )