以下大雷
以下个人想法，在不无限脑补的情况下，先把世界分成三层
第一层是现实世界，第二层是大坚书世界，第三层是小坚书世界(一开始的主世界)
三个世界共同的关键：
1.要提取数据转移(修复)大脑，必须要容器跟对象心里状态非常接近
2.都有京都编年史计划(或是类似的纪录方式)
3.坚书跟一行会交往，然后有一个人会事故脑死(第三世界无)
而这部主要就是在描述每个世界“发生了某件事”而导致“某人”因为想救“某人”采取的“某些行动”
以下把三个世界分开描述，从第一层讨论到第三层，没有加入第几层的人物就是原本那层的，前半是有人转移前后半是有人转移回来后
第一层世界(现实)：
前半：
坚书跟一行在一起后，某天发生了事故(有可能是看烟火被雷击也有可能是别的事)，坚书为了救一行而受伤脑死(当时心里：为保护他人而不顾一切)，一行则为了要唤醒坚书持续学习并加入教授的研究室，最后与研究团队共同找到方法治疗坚书，就是由这个世界的一行进入第二层提取坚书资料
后半：
一行把第二层坚书带过来，坚书醒来
疑点：为何结尾在月球
想法：避免矛盾(第二层一行的情况，或许容器跟对象在不同地点/星球的话就可以避免)
第二层世界(大坚书)：(重点：我们不知道现实一行在这里做了什么，只知道最终目的是重现坚书在现实的心里状态)
前半：
由于现实一行来做了某些事，导致没有发生大坚书为救一行而脑死的事件，而是一行被雷击而脑死(当时心里：喜欢坚书)，坚书学习并加入教授研究室，爬上高层后自己研究唤醒一行的方法，偷偷进入第三层提取一行资料
后半：
让一行醒过来后却被系统发现并判断要排除(此时大坚书意识到第二层也是数据世界)，快保不住一行时小坚书(+现实乌鸦一行)出现，最后小坚书把一行带回第三层，现实一行把符合心里状态的大坚书带回到第一层(现实)
所以这个世界最后是没有一行也没有坚书的(因此教授：不知道他们会到哪里去)
疑点：现实一行在那？
想法：在暗中推动大坚书的学习方向，然后在大坚书进第三层时变成乌鸦让大坚书以为是他的能力顺便带小坚书
疑点：最后程式爆走，大家不知道自己在数据世界？
想法：他们看到了还是不会觉得自己在虚拟世界，只会觉得有怪物之类(但教授应该知道了)
第三层世界(主视角)：
前半：
大坚书跟现实一行(乌鸦)来找小坚书，最后避免雷击但大坚书把一行带去第二层
后半：
小坚书跟一行回来，但这时的第三层已经重组过，变成了一个新的世界
时间轴：
http://i.imgur.com/u67TXYV.jpg
大概是这样，刚看完粗略整理一下，希望有不同想法的人可以一起讨论～
题外话
现实的眼镜一行好正><