首先要了解 iTunes 备份和 iCloud 备份有点不一样，不过我的 iTunes 备份经验是之前 Mac 版 iTunes 还有 App Store 的时候，后来我就换成 iCloud 备份了，所以可能会和现在的情况有所出入。
我从不同 App 的型态来说明你可能比较好理解。
先说 iTunes 备份和 iCloud 备份“不会备份”的内容：
iTunes 备份不会备份以下内容：
- 已经在 iCloud 的东西（行事历那些，如果你有开启 iCloud 功能）
- 从 iTunes 同步过去的东西（音乐那些，这些东西受你的 iTunes 管理）
- 在 iTunes Store, App Store 之类的地方的已购买的项目（书、音乐、电影一类的）
iCloud 备份不会备份以下内容：
- 已经在iCloud 的东西
- 已在 App Store 的内容（即所有 App 的主程式）
！！！注意， iCloud 备份不会备份 App 主程式喔！一来太占空间，二来这可以载回来。
Apple Pay、Face ID、Touch ID 那些基于安全性的则都不会备份。
以上大概就包含了所有原生 App 了。
其他 App 就有很多种情况，这其实跟 Apple 和 Google 无关，他们都有提供很多方式，但还是要看 App 开发者自己，而有时开发者也会因为各种限制而无法用你理想的“一键还原”。
首先最一般的工具型应用，我以 Sacnner Pro 来举例：
iTunes 备份和 iCloud 备份只差 iTunes 备份包含 App 主程式。还原回来都会和你原先的一模一样。
但是，如果你有设定扫描完自动上传到 Google Drive 之类的，那就还要在登入一次，这跟 Apple 无关，这是基于安全性的应用程式授权问题，基本上现代服务都会这样。
Line 那些通讯软件：
基本上都要过他们自己的换机流程，而聊天纪录那些则依各家设计，有的是在他们自己的云端、有的让你备份到 iCloud （注意，不是 iCloud 备份喔，iCloud 可以让 App 备份资料到 iCloud 上，但不是在你 iCloud 的手机 iCloud 备份里）。
现代比较注重手机绑定的 App 设计大多这样，WeChat、Skype 好像不用，设计上比较偏 Web 服务，不过不是说你就不用登入，只是我记得他们只需登入帐号，没有换机流程。
游戏类
如果是有提供 Game Center 连动的，你只需要打开游戏、选择 Game Center 就好了，不用登入，因为你已经登入 Apple ID 了。
第三方帐号连动，Facebook 之类的，跟 Game Center 基本一样，只是照理还是会要你登入该服务以做授权，这是安全性问题。
跟游戏开发商帐号连动的，这不用说，大多要走他们自己的换机流程。
———
结论
所以基本上你可以看出来，几乎没有你不用再登入认证一次的（除了原生 App，不过其实你在一开始登入 Apple ID 的时候就登入过了）。
系统设计上，大概不会有你想像的那种“一键还原”，这是系统安全性问题，因为那样的话就代表，只要我拿到了你的 Apple ID 帐密，我就取得你一切资料。
实际上不管你用哪种方式备份还原，如果你的联络人、行事历、邮件是使用一个或多个 Google 那类服务，换机之后你还是要去“帐号与密码”那边一个一个登入以再授权一次。
※ 引述《supermars (讨论时冷静占上风)》之铭言：
: 我不了解APPLE机制但想多询问多了解一下~
: 目前我知道的iPhone(iOS的设备)在资料备份时使用电脑上的iTune 或 iCloud(应该是
: 这名词?)，那么资料还原的时候“所有的APP/游戏”都完全不用再次输入帐号密码吗?
: 联络人、短信、通话纪录不用提那一定是基本款?吧。
: 哪么像是第三方的软件/游戏在APPLE备份还原后是否也不用做帐号选择?
: 像Android游戏如果是走FB帐号绑订货GOOGLE帐号绑定时，除游戏安装完毕、更新资料
: 完毕后，游戏启动时"基本上"还是得按一下连动帐号后游戏才会旧的纪录(不然就全新
: 开始)。
: PS:也有遇过安卓的游戏在初次开启后旧直接都入GOOGLE帐号的这种设计
: 但因为我玩的游戏都是日本限定(需跨区)居多，日本那边的云端备份设计还是
: 以该公司服务器的特殊引继码居多，再来才是推特连动、近期才是越来越多
: 可以让GOOGLE帐号连动
: 如：
: ★手机重灌让手机归零状态后(如全新机)，登入APPLE还原或使用iTune还原时★
: 1.APPLE的GAME CENTER是否会自动登入?还是要手动点进去启动?
: 2.目前IOS平台的软件、游戏在系统还原完成后，所有APP(无一例外?)都不用另外点APPLE
: 帐号进入、即可使用先前的纪录?
: (EX: 银行软件不用输入帐号/密码/用户代号)、脸书/推特不用输入帐号密码甚至双重
: 验证