我参考下列PCDVD的文章后解决了，我的电脑上确定是由HiCOS智慧卡程式引起的
http://www.pcdvd.com.tw/showthread.php?t=1134192
我的解决供参考
1.终止程式和停止写档
打开Windows工作管理员，到"处理程序"页，找到"TokenUtility.exe *32"这个，按"结束
处理程序"，然后我的随身碟就会停止写入"smart_io.crt"的动作。
2.取消开机执行
按"开始"，输入"msconfig"，出现"系统设定"视窗，选择"启动"页，找到"HiCOS PKI
Smart Card Token Utility"这个项目，把打勾取消，开机就不会被自动执行。
3.移除程式
到控制台新增移除程式，找到"HiCOS PKI Smart Card"，移除。
※ 引述《goodsnk (天天PO)》之铭言：
: 请问随身碟出现奇怪的隐藏档
: SMART_IO.CRD和.SMART_IO.CRD
: 删掉又马上会出现
: 这是随身碟有问题吗 ?
: 还是什么问题呢？
: 谢谢喔