万华那波疫情我很有印象
4/20的时候，两位从美国飞回来的机师(案1078, 1079)验出病毒阳性。
而在同一天，澳洲也通知有一名台湾的机师验出病毒。
之后新北、宜兰，之后全台各地开始出现案例。
扣除掉这三个案例，
最早的案例就是在台北市发现的，所以台北市会是破口吗?
以现代流行病学来说，
发现案例的城市不一定就是病毒的起源地。
这边首先要厘清几个问题，
1. 各个群聚案是不是来自同一个起源?
2. 如果是，那么起源的时间与地点是哪里?
要回答这些问题就需要从病毒序列来看
当时CDC公布只说spike序列是一致的
这段序列因为变异性很高，因此可以拿来朔源。
不过对病毒有些了解的人会说这段序列只占全长的约1/10左右，
有可能刚好在spike上一样而已。
然而事实是，
从全基因组来看，
全部的传染链都是同一个起源，
而且这个病毒序列的特征只在台湾有。
简单来说，
引发这波疫情的病毒起源不像有些人说的那样是从美国带回来的，
而是在台湾产生的。
而且有趣的是，
被认为是最早案例的1078, 1079，
从他们的序列可以推断，
他们甚至也不是最早的案例了。
这一波疫情如果做最早共祖分析，
得出的结果是这波疫情的源头
早在3月中旬就已经产生。
这其实跟事实也吻合，
因为1078及1079根据Ct值，
就已经发现是在不同的感染阶段了。
(而且前面也说他们不是最原始的病毒序列了)
而且机师跟家属在检验的时候，
有不少显示阴性，但血清检验显示他们早就感染过病毒了。
(当时台湾清零一阵子了，不应该感染过。)
这些感染者唯一重叠的足迹，
就是都在桃园的防疫旅馆隔离过，
加上早在3月源头病毒就已经产生，
可以合理推测病毒源头应该就是潜藏在这里。
如果真的要说为什么会爆发疫情的话，
我个人的立场是认为防疫旅馆的管理有改善空间。
可以说是，
如果病毒管理得当，
病毒根本不应该离开桃园，更不会扩散到台北新北以及全台各地。
至于跟3+11(4月14日)有没有关联，
这点不是我的专业，我也没有任何科学依据。
不过我个人的想法是，
改成3+11迟早爆开，
但第三波疫情我自己觉得是在3+11之前已经悄悄蔓延了。