我觉得你讲得很有道理，而且有提出论文资料，虽然我也没去验证你的资料。
不过我有些疑惑一直以来不得解决，如下述这些：
※ 引述《iuvat (disquietude)》之铭言：
: 原文吃光光，
: 虽然我不是这方面的专家，但本鲁曾经心血来潮做过小小的数学计算可以跟大家分享。
: 首先，同姓不能结婚这个问题(简称“同姓不婚”)最早可以溯及西周，基本上整个东亚
: 文化圈或多或少都有相关的规范或习俗在限定同姓氏的婚姻上，以台湾来说，我们对于
之前我提过一篇废文〈日本自孝明天皇之后都有戽斗,是谁的问题?〉
底下推文有板友解惑：
推 EXZUSIC: 日本也是近亲导致的吧？119.77.180.9 06/14 05:35
推 Peter521: 日本皇后都五摄家的人223.136.202.63 06/14 05:57
推 info1994: 圈子那么小223.139.186.122 06/14 06:14
→ chart: 大正以前几乎都近亲繁殖，跟欧洲没差多少101.9.197.35 06/14 07:27
推 chart: 昭和天皇的妻子香淳皇后也是有皇族的血统101.9.197.35 06/14 07:32
→ chart: 是明仁破天荒娶了平民美智子后才打破常规 101.9.197.35 06/14 07:32
我想，或许日本皇室是个特例吧，是否是因为日本天皇没有姓名，
所以没有姓氏问题？所以都能和自己的近亲结婚？
: 同姓不婚的法律规定主要仅考虑几亲等内不结婚的状况，并没有对于同一个姓氏进行
: 规范，然而其实早期传统上是排斥同姓婚姻的，著名的例子有台湾作家钟理和跟钟台妹的
: 婚姻，由于不被祝福，所以在当时遇到很多阻碍。
: 一般来说，禁止同姓婚姻的原因有二，第一担心近亲通婚基因缺陷的问题，第二则是以
: 姓氏作为地区集团的划分方式，因此利用禁止同姓婚姻来壮大自己的势力。行文至此，
这个就和我大学时读到的不一样了。
台湾早期移民社会，漳、泉、客、原都会械斗，大部就是因为利益的原因，
什么资源林业的开采、埤渠轮时灌溉之类有的没有的。
有时候是A姓战B姓，有时候是漳州战泉州（其他的自己排列组合），有时候是大乱斗。
在其中的不同州之战，对立的不同州也是有同姓的，还是这样对战。
而且闽客之间也是会有同姓的人，但还是会战起来。
这样好像就和您的说法“姓氏作为地区集团的划分方式”有些不同了。
但您说的应该还是有其道理，毕竟我读的文章要翻找才能看到，看到也不知道几年后了。
说出论点很难得，反驳或挑别人毛病很容易，所以请您别当成我与您在辩驳。
只是提供我所知道的给您参考。
只是明明是同姓，在台湾早期移民社会还会因祖籍地域不同而斗起来，
而那些祖籍地域不过就是闽南的邻近地区，祖先搞不好还是同一批人，
能够因利益战起来，还真的蛮不顾血缘亲情的，是我多年以来未解的疑惑。
但新闻报过很多亲兄弟为了家产闹翻互告的事情，感觉好像疑惑自然得解。
总之还是觉得很怪就对了。
: 本鲁就很好奇，在多少的人口下且在怎样的姓氏下有可能会跟你同姓的跟你血缘很近，
: 举例来说，陈是台湾大姓，那姓陈的遇到姓陈的感觉血缘就不太会很近，此外，如果在
: 大都市遇到跟你同一个姓的，感觉也不太可能是亲戚，为了研究这个问题，阿本鲁
: 不会跑数据库也不知道怎么做资料分析，所以我使用了改良版的two-parent的
: Wright-Fisher模型，去看说在不同的人口数跟不同的姓氏比例下，亲等关系是否真的
: 同姓的会比不同姓的近很多，Wright-Fisher模型通常用在于基因染色体遗传的数学分析
: ，而Yale有位教授发表在nature的论文里利用这个模型去计算人类共通的祖先距今差几代
: ，本鲁就单纯拿这个模型来跑亲等关系(亲等的定义采用台湾的定义)，发现了一些有趣
: 的现象:
: 1)即使人口只有不到一千人，不同姓之间跟同姓之间的亲等并没有差很多(平均差不到一
: 亲等)，而且主要的差距来自于二等亲的部分(自己的兄弟姊妹)，但老实说，通常
: 你会知道你的兄弟姊妹是谁，并没有需要透过姓氏判断。
: 2)如果限制同姓婚姻，在人口数少的状况下，很容易造成姓氏的比例下降，达到的稳定值
: 大概都会低于10%，所以其实对于小村庄来说，禁同姓婚姻反而更容易让自己的家族缩小
: (我觉得满反直觉的，也有可能我少考虑一些要素)
: 综上所述，根据本鲁很废的研究(因为我就用我的烂笔电跑所以只能做人口一千多人的
: 模拟)，其实禁止同姓婚姻于基因或于集团来说都好像没什么意义，或许以前会禁
: 只是单纯因为对于基因的不了解而造成的差异吧，毕竟欧美很多地方自古就没有
: 再禁同姓婚姻对于人类发展好像影响也不大，以上是我无聊时做的业余分析的
: 感想，至于详细内容因为不会发表我也有点懒得贴图上来所以就当看看就好，
: 没有peer review我也不是相关科系很难说这样的分析真的是合理的，
: 感谢看到这里的大家~~
: 相关文献:
: 1.FISHER, R., On the dominance ratio. Proc. Roy. Soc. Edinb. 42: 321-341. 1922.
: 2.Wright, S., Evolution in Mendelian populations. Genetics 1931, 16 (2), 97.
: 3.Chang, J. T., Recent common ancestors of all present-day individuals.
: Advances in Applied Probability 1999, 31 (4), 1002-1026.
谢谢提供的意见，获益良多。