北投站轨道配置图 http://i.imgur.com/wUAHP3w.png
新北投支线，该线在兴建淡水线时就一并规划，原本是主线命，
有两座月台且可容纳六节车厢。不过因为轨道与民宅过近，而降为支线且减班。
曾经该线在早上七点前和晚间九点后还直接停驶改以公共汽车接驳。
不过新北投支线在北投站可是有独立月台和轨道，
完全不会影响淡水信义线列车营运和调度。
至于部分列车怎么只开到北投就停，当然也跟新北投支线无关，
这样作法是区间车营运模式，往南也只开到大安。
春节时为应付关渡和淡水人潮，往北投区间车也都会开到淡水站运输。
新北投支线是否有一天会成为主线终点站也说不定，
不过支线营运代表列车也独立行驶，因此发展出新北投温泉列车，
也算是另一种特色吧。
七张站轨道配置图 http://i.imgur.com/StUeqp7.png
小碧潭支线，该线是在新店线盖好后才冒出来的，
所以本是支线命，小碧潭站仅一座月台且只能停靠三节车厢。
除此之外还占用七张站的月台和轨道，
每隔一阵子就会吵区间车只到台电大楼站的议题，
而元凶就指向小碧潭站因占用袋状轨导致区间车无法延驶到大坪林站。
以至于包含公馆站以南乘客听到“二月台列车往台电大楼”就一肚子火。
不过捷运公司还是在尖峰时穿插往新店列车，所以看时刻表会发现，
就算是公馆站也一样有三分钟班距，而不是永远六分钟以上的悲剧。
而小碧潭支线一方面占用轨道和月台，另一方面就运量真的太低，
让有些人觉得就算废站也不会感到可惜。