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科技大老张忠谋、童子贤、简立峰等民间科技委员在新政府第一次行政院科技会报上热烈发言，轮番评论新政府的科技预算编列方向，其中和硕董事长童子贤在科技会报上，特别为文化部、国防部、内政部等部会的“科技应用”预算的短少请命，他说，“科技应用”的预算太少了！
童子贤批评属于文化部、内政部、国防部、教育部连同行政院其21单位，一共25个“科技应用”单位，只分配到总共15%的科技预算，而属于“科技建设”的经济部、科技部、中研院、科发基金就用掉907亿，占总数1072亿的85%，占比例很高。
童子贤说，基础建设固然重要，但是会产生产值与经济贡献的，通常都是“科技应用”。观察最近很夯的任天堂的PokeMon，其实就是注入“文化元素”的科技应用。近年来注入文化元素的日本、韩国与中国游戏与戏剧产业，一直在产生庞大产值，也影响他们的相关股市走上荣景。
童子贤：台湾擅硬件、轻软件应用
童子贤指出，科技预算的编列，太像台湾的产业结构，擅长硬件而轻忽软件，甚至轻忽应用。他说产业结构已经改变，游戏的产值、戏剧的产值，已经追上硬件的产值，甚至超越硬件。例如任天堂的股市市值，因为PokeMon宝可梦的走红，短期就追上并超越Sony。
童子贤担心行政院因为不擅长管理科技应用预算，担心预算落实问题，以至于宿命式的、循环式的、求安心式的只着重“科技基础”预算。
他呼吁，其实在影响总预算不大的情形下，能增加文化部等部会的科技应用预算，例如强化游戏、戏剧、影视等“内容产业”、“游戏产业”，最少作到“进口替代”的观念，否则像香港“神魔之塔”、日本“宝可梦PokeMon”、美国NetFlix“纸牌屋”、中国优酷网与爱奇艺“甄嬛传”、“琅琊榜”这些强势进口“文化”产品在台湾攻城掠地，台湾就是忽略了在地文化元素与科技的结合。
此外，他也呼吁，鉴于ATM盗领案的教训，政府也增加预算来强化“资安”。包括财政部、内政部警政署、法务部调查局这些单位在“网络”“资安”的实力，应该提高经费也提升实力。