个人见解。
以我这张图来说：
https://i.imgur.com/DFUwtE8.jpg
他总共有 12 个图层，但是...
https://i.imgur.com/kpwkazC.jpg
从右下角最底下往上数，
"纸张" 和 "BG" 就只是底纸和背景。
再往上三个图层是平行尺规和 2022 的字样。
https://i.imgur.com/qkdNnHg.jpg
也就是说底下五个图层和上面的人物都没关系。
上面的七个图层分成了两个资料夹，
最上层的资料夹含三个图层，是草稿线稿，最后不显示，
下层资料夹含四个图层，是实际成品显示的上色图层。
上三层草稿分别长这样：
https://i.imgur.com/tAEkOAw.jpg
它们产生的顺序是由左至右，
由于我要的只是最右边的草稿，
前面两个其实也可以删除或合并，
留着是想万一图要大改...
但其实我可以改最后一张草稿就好。
最后四层上色曾分别长这样：
https://i.imgur.com/X26kL9x.jpg
最底下的是左上，大部分的皮肤和一点后面的头发；
次之是右上，放在前面的手腕，更多后面的头发，牙齿眼白和老虎身体；
接着是左下，老虎的脸，以及主角的前头发、瞳孔睫毛和嘴唇；
最前面的右下...其实只是最后临时补上的老虎触须而已，其他什么都没有。
这张应该没怎么合并或删除过任何图层，
所以整个作画过程的图层就是这些。
回到要怎样节省图层的话题，
草稿的部分我想比较好办，
画完细草稿后，前面的粗草稿可以删掉或合并。
照我自己的逻辑，草稿到上色后，
应该只需要人物和背景分开而已，
上色人物的时候把背景关掉避免干扰，反之亦然。
如果有多个人物的话，只要没重叠到，
在同一个图层也行，甚至重叠就给他重叠。
这么说来的话全部在同一个图层也是可以。
草稿会很多层又删不掉，
我能想像得到的情况，
就是人物裸体一层、头发一层、
衣服一层或好几层、什么配件又一层...
我可以理解会想这样做的感觉，
但除非是要画差分，不然这么做的意义真的不大。
人物和背景会想分层，是因为把他们视作不同的东西来理解，
分层有助于厘清自己的图，
但太细的东西就没必要分太多层了，
如果一定习惯要把它们分层才能画出来，
那就在最后合并成一张草稿，重叠部分后面的线就擦掉。
上色的部分要怎样减少图层，
我觉得这问题比较复杂，
因为这关系到你上色的技法。
不少对动漫 CG 人物的教学，
可能都会教你人物皮肤底色一个图层，
阴影一个图层，高光一个图层，
然后再一个图层补细节微调...
重点是阴影还要用色彩增值之类的图层功能，
假如一定是要照这种技法去画，
那没办法，就只能不断开新的图层来用。
当然画好一层以后把它和底层合并就行了，
但我猜很多人不想这么做，
因为之后要改的话怎么办？
不过，我觉得可以衡量一下，
就算把图层合并了，
回复上一动所要花的成本真的有那么高吗？
这图层可能就加一点点修饰而已，
那干嘛不直接画到别的图层上就好？
把很多只做些微点缀的图层，
干脆直接画到别的图层上就好了，
假如之后那个点缀不要了，
那就拿出修图的本领把它修掉，
图比照片好修得多，更何况还是自己画的图。
再来就是不用太死板的一个物件一图层，
只要不重叠到的东西，干脆就把它堆到同一层算了，
依自己的作画方式方便就好。
以我那张老虎图来说，
分层方式首重的显然就是画人脸的方便性，
所以皮肤→牙齿→嘴唇、头发、瞳孔，
用了这样的排列方式。
但是皮肤一路延伸下来的右手臂，
抱住了老虎，就应该分到更前面的图层才对，
而不是在最底下的图层。
但是这也没有关系，用锁定透明度的功能，
把老虎要上色的部位先锁定好，
最后就像右前臂在老虎图层前面一样。
当然我也可以从衣服肩带处把右臂切下来，
把它分给前面的图层，
我画老虎的时候可能就会比较轻松了，
不过，这样右臂和脸部就是分开的图层，
当我想要调整皮肤时，势必得在两个图层之间切换...
但我觉得这没有绝对的对错，
哪种方式都可以用，只是看习惯而已，
我在分层的时候也没想太多，
怎样方便就怎样做。
我猜有些人的症结可能在于，
一定要在某种程度上分图层，
图层分派的理想程度，几乎关连到了图本身的完美程度，
不过就实务上来说，其他人最后只会看你的成品，
图层分得怎样别人是看不到的。
所以突破了一定要把图片上的东西，
像图书馆归档一样用图层分类好的心魔以后，
问题就只剩下，是不是一定要用这么多图层，
才能把图画出来了。
多用图层不是不好，
把图层发挥得很厉害绝对是有它的好处的，
所以这样作画的人大有人在，
这绝对是可行的。
但如果自己尝试后认为这样不好弄，
可能是图层太多搞到自己头大，
或是分太多层拖垮电脑效能，
那改变自己使用的技法，
让自己不再需要分那么多层，
才是解决问题的根本之道。
反过来说，电绘虽然有图层功能，
但也没规定你一定要用，
完全只用一层画出高精细度线稿彩图也是可行的，
而且听起来如此麻烦的事，还是比手绘还要轻松。
如果怕不分层会乱，图会看起来不干净，
那只能说...这完全是可以克服的，
只是自己的技术问题而已，
就是练习不用图层把图画出来。
至于如果只是用了很多图层，
要修改大范围颜色怎么办的话，
那其实不是大问题吧。
把要修改的每个图层都复制一个，
把复制出来的图层全部合并成一个图层，
用锁定透明度或遮色片的方式，
不就能得到要修改的所有范围了吗？