“半薪免税”救火，能堵住逃亡潮？医师缴税不为人知的2个祕密
更新日期 ／ 2025-06-16
．文 ／ 邱宜君
．责任编辑 ／ 连珮妤
．出处 ／ 康健编辑部
．图片来源 ／ Shutterstock
https://www.commonhealth.com.tw/article/92811
为挽回医院人力，健保署提出“半薪免税”，医界多叫好。但你可能不知道，医师缴税的
税额也有“阶级”之分。
健保署日前一场会议，将影响全台湾大约3万5千名医院医师的实质收入，最快明年报税时
，医院医师的“加班费”就可免税，免税比率可能达到半薪，藉以抢救人才。
健保署此举意在打破公私医院间现行潜规则，以及诊所与医院间的税务差异。根据《康健
》记者调查，许多私立医院早已将医师薪资部分比率列为“免税加班费”，公立医院却相
对保守，形成公私立医院间落差，资薪幅度愈差愈远。
另一方面是诊所报税的减免空间较医院大，造成医院人才不断流失，社区医院协会荣誉理
事长谢文辉不讳言，开业医收入先扣除很大比率的“成本”才课税，实质收入是医院受雇
医的数倍，生活品质又好，更让医院医师萌生辞意。
医院医师半数工时可报免税加班
根据当天会议结论，当主治医师或住院医师每日工作超过8小时、每周超过40小时，或休
假日出来工作，就算延长工时，这些工时相对应的加班费，要适用《所得税法》的加班费
免税规定。至于加班时数的上限，一般劳工是每月46小时，医师则是采取每月总工时的
50%为上限。
健保署署长石崇良表示，医院医师工时长，许多科都需要待命或随传随到，却没有免税规
定，不符合税务公平，所以才会开会讨论哪些工作算加班、加班标准是什么，以研议新做
法。
他举例说，未来如果一位医师每周总工时是80小时，当中最多有40小时可以是加班时数，
这40小时的收入可免税。上述结论的执行，可由卫福部以函释方式通案处理，或由健保署
修订“全民健康保险医事服务机构特约及管理办法”，需再进行跨部会讨论。
石崇良强调，现在最多只能算46小时加班免税，对超长工时的医师并不公平。若明定免税
加班时数上限为总工时的50%，公私立医院都适用会比较公平，也可借此留住医师在大医
院。
现行公私立医院做法大不同
健保署大费周章开会讨论，台面上没说的是现行医师收入已有加班费免税。一名私立医院
主治医师F表示，很多私立医院的医师薪资，都有一定比率被列为“加班费”，由医院上
报国税局，医师这笔收入就免税，有些薪资单甚至列出“免税加班费”这一项，金额将近
是当月薪资的4分之1。
但医师并不适用《劳基法》，正常工时和延长工时都没有定义，加班费也没有计算依据，
医院怎么报加班费？连不用加班的科别也有免税加班费？“医院敢报，不要太离谱，国税
局只能相信，”F说。
私立医院的做法，造成公立医院在召聘医师时更弱势。台北市医师职业工会祕书长陈亮甫
表示，公立医院的人事或会计通常是公务员，如果医师没加班却报免税，可能涉图利罪遭
重罚，所以大多数公立医院都不想报或是报的极少，曾有工会会员医师亲临国税局举证，
才争取到退税。
反观私立医院，大部分都有为医师报免税加班费，且各院、各科免税额度的高低不同，早
已是医师口耳相传、比较待遇的重点之一。
诊所医师免税空间比医院医师大
另一项棘手的问题是，诊所执业医师的免税空间比医院受雇医师更大。一位不愿具名的资
深会计师L表示，诊所若有找会计人员制作帐簿文据，可采“实质课税”，根据“实际收
入”扣除“实际成本费用”后的所得金额，去申报所得税。然而，很多开业医师工作繁忙
没空记帐，或为节省成本而没有请会计，结果无帐可查。
国税局人力有限，为了简政便民又能课到税，针对无帐可查的诊所便采取“推计课税”。
L会计师表示，诊所主要收入来源包括健保、自费，健保收入容易掌握，自费收入仰赖诚
实申报，国税局会依据诊所逐一记载举证的成本及收入相关资料，去推计应申报的营业所
得。
“法理上有选择性的时候，就会产生税赋差，”L会计师表示，法规只规定有实质课税，
推计课税是不得已的办法，却让医师有了选择性，创造出税赋差。若要解决推计课税的税
赋差、杜绝逃漏税，国税局人力恐怕加增10倍都不一定够。
100家医院有超过100种算法，做到3件事才能合法免税
既然诊所问题难以解决，健保署只好回到医院里开创免税空间。但到底医师的加班时数和
加班费该怎么算才合理？
以医师工作的特殊性，仍有许多问题待解。“医师的薪水不是按照工时算的，”F医师举
例说，A医师值班一晚，开了一台给付很甜的刀，B医师值班一晚，都没病人，如果值班等
于加班，他们加班时数都一样，为医院创造的收益不同，所以A、B医师这一晚的酬劳绝对
不同，加班酬劳与加班时数关系不大。更何况可能有医院借此漏洞，直接将医师一半收入
列为免税加班费，藉以逃漏税。
资深会计师L分析，医师是高薪资所得的职业，要求比照一般劳工的加班时数免税规定，
可能引发负面社会观感；医师加班费算法也比一般劳工复杂得多，100家医院的加班费算
法可能超过100种。
若要以理服人，最重要的是建立一致性。L会计师表示，每周、每月、每年，都要有一致
的标准去计算工时，也不能因人而异。这套标准必须公开、透明，而且经劳雇双方同意，
任何人去验算，都算出一样的结果，这就是一致性。
其次是医院必须提供国税局完整的工时纪录。如果行政教学研究算工时，都要记录下来；
没有固定打卡时间的责任制，也要确实记录时间。
第三是加班必要性的证明。一般劳工的加班费，必须有主管提出工作需求，确实有延长工
时的必要，才能算加班。诚实提供医师工时纪录、加班必要性的证明，才能满足免税所需
的财税规定。
工时基础非常重要，L会计师强调，因为现行法规的“加班免税”，其实是“工时”免税
，不是“工资”免税。也就是说要先有加班的事实，才用公开透明的标准将工时换算为加
班费免税额，而不是希望有多少工资免税，就把这一块切出来说是加班费。
出身急诊的健保署署长石崇良忧心忡忡，他说明将推动3措施、3计划改善急诊壅塞，也对
全台医师提出恳求，对院方提出呼吁，立即阅读〈急诊快崩盘！健保署3计划抢救，“请
再给我们一点时间”石崇良亲上火线恳求〉
收入只是原因之一！2关键才是止住医院人力流失的特效药
虽然还有许多问题须解决，但医界普遍乐观其成，期盼是一剂能止血医院人力流失的特效
药。
台湾医务管理学会理事长洪子仁表示，长期医疗人才流失严重，医院设法提高薪资，政府
也给予免税鼓励，双管齐下，都是为了提高留任诱因，让医院执业环境变好。医学中心协
会理事长陈建宗也说，希望这能达到鼓励作用，让所有医师更愿意留在自己的岗位上。
然而，台湾医疗改革基金会执行长林雅惠提醒，“收入只是让医师离开医院的众多原因之
一。”近期医院离职潮当中，已有急诊医师发出“这种工作环境，钱再多我也不要做了”
的不平之鸣，这显示，唯有有效保障等薪酬待遇和劳动权益，才是更根本的留才之道。
这篇文相当长
简言之就是在谈医院医师报税之探讨
最近真的是文章连发
不知道有没有用?

改这种皮毛有什么用？自请下台吧

医生会缴这么多税就是多亏一楼的偶像杨志良先生啊公立医院也是可以值班费免税的，只是只要医生没去吵，行政人员就是装死当作不知道

下班时间做晨会报告算工时吗

税虽然有差 但不是医院医心死离开的主要原因吧

康健有什么政治能量我是不相信啦==

唉民进党只会搞这种小手段 还是我们壮壮们最爱的杨志良才可以拯救世人

石崇 杨志 超级赞

不是没吵过喔 吵了跟你说其他人都没这样做 没有一个依据他们没办法

笑死~~ 还想骗?? 谁有拿过加班费?

这个钱还是被医院拿走吧

内文提到国税局增十倍人力都不一定够查医院诊所谎报、逃漏税，是不是故意做球给健保署接？以后除了“A健保”外，又多了“医师集体逃税”这个操纵舆论打压不听话医师的工具了

没关系吧？就继续离职，让医院继续崩

说个笑话 公立医院的会计跟计算方法

问题是医院的外科医生随便都周工时>100

当住院医师这么多年，周工时一百小时也没看过什么鬼加班费

笑死？骗40%？？？！

不用太期待现在的政府喇，民进党朋友都说缺乏幕僚到政务官没什么心力做出什么有远见的思考ㄌ，苏院长那时候至少一堆自己子弟兵幕僚充足，现在满朝左胶，我是觉得不需要有太高期待喇嘻嘻，医护崩溃说不定最后要说大罢免完就能解决了，对吧^_^邱宜君记者跑去康健，那联合之后会都剩下北顶好业配吗嘻嘻

诊所很多受雇的不用缴税吧，征人直接说税务诊所处理

公立医院的会计就是行政怠惰啊，卢到他们受不了他们就会处理了，而且实际上医院没损失

请不要质疑你的大脑袋官员

超过8小时就算延长工时？ 要确馁 现在是10小时 礼拜六还要做白工

值班不是加班 一句话就压死

敝院人事就这样认定...写在班表上就不算加班

主治医师责任制，哪有加班费！公立医院值班一天几百块而已

用这个方案是真的把医生当猴子了

笑死? who cars? 绿蛆吗? 问党啊!

先从卫福部医院实施才有说服力啦

on call不给钱就不算加班啦~~~~哪有上那么多班!!?

不敢涨健保费都没用

：再囉嗦就安排下次大选完后会议再讨论

跑就跑哪有差

最近听到高中生抱怨没考上牙医，只考上医学系,觉得很丢脸和失望的言论官员真的很烂，把台湾医学搞成这样？！把升等绑科技部计画删掉，应该会留住一些人？！

要卖命才能升等，那就干脆不要升等，自己当老板

现在升等除了卖命还要卖脸面 脸面不够 贱命一条罢了

明明很简单~不想认真做的时候就把他搅浑罢了....住院医师已经适用劳基法对加班值班费免税好处理主治医师免打卡难以界定上下班时间去吵加班免税是搞笑主治医师就改成执行业务所得就好也符合实际情况 工作必要的支出如听诊器书本医师服...等还可以列举扣除既合法又符合实际运作 石崇良念过法律不会不懂啦....

继续调涨挂号费+自费费用~~爽赚百万

报税软件输入医师执照号码减半比较有用