因为这个问题困扰很久了，大概每两三天就会发生一次
找了很多地方，说法有很多，有人说跟JB有关有人说无关
有人说跟型号有关也有人说无关
症状就如原po所述，重开机都发生在半夜而且在充电时
版本9.0.2 有JB
后来找到这篇讨论：
https://redd.it/3sh9ij
里面说可能是系统定时清除内存的行为造成
症状就是如果半夜有重开机时
去设定->隐私->诊断和使用情况->诊断和使用资料
看看有没有SystemMemoryReset的报告出现在重开机时
内容大概像这样：http://pastebin.com/JFVwMcAP
注意第10行写的：
"System Memory exceeded limit: 413.06 MB vs 225.00 MB"
表示系统使用了>225MB的内存因此触发了重置
问题是其实iPhone6S有2GB的RAM啊XD
所以可以借由调整这个上限暂时解决问题
方法是用类似iFile/Filza来开启以下档案：
/System/Library/LaunchDaemons/com.apple.jetsamproperties.N71.plist
(如果是三星)
/System/Library/LaunchDaemons/com.apple.jetsamproperties.N71m.plist
(如果是台积)
(也可以两个都改啦XD)
要修改的地方是：
<key>UserHighWaterMark</key>
<integer>225</integer>
把225改成大一点的数字，讨论区说改384/512/768的都有
个人是改512，重开后使用两周都没有重开机症状，也没有其他后遗症
有一样困扰的板友可以考虑服用，
记得修改档案前备份好就是了！
※ 引述《miso0816 (味噌)》之铭言：
: 5s从来没遇过
: 自从换了iPhone 6s发生了两次
: 就是晚上睡觉时插著充电，结果早上醒来要指纹解锁
: 结果显示重开机后第一次只能使用密码解锁！
: 只有在睡觉时插著充电会出现这种情况
: 如果睡前充保或是玩游戏插著充电好几小时都没出现过
: 请问有使用6s的有一样问题吗？
: 版本是9.0.2 有JB