本表整理出从 99 年到 110 年，采计五科的排名，以 99 年名次为主做排序。
期间有许多科系小改系名，会放入同一校系中。
若是有分组的，例如清大物理组有再分一般组与天文组，则以最末排名为主。
若有错误或是有改采改名改分组的再跟我说一声。
99 100 101 102 102 104 105 106 107 108 109 110
国立台湾大学物理学系
[ 1][ 2][ 3][ 3][ 3][ 7][ 7][ 5][ 8][ 10][ 14][ 19]
国立清华大学物理学系光电物理组
[ 14][ 20][ 21][ 23][ 26][ 28][ 33][ 47][ 46][ 39][ 45][ 41]
国立清华大学物理学系物理组
[ 31][ 33][ 34][ 39][ 39][ 35][ 29][ 43][ 39][ 36][ 40][ 42]
国立交通大学电子物理学系光电奈米科学组
[ 32][ 36][ 39][ 46][ 37][ 32][ 39][ 36][ 36][ 30][ 32][ 29]
国立成功大学物理学系光电科学组
[ 37][ 22][ 29][ 34][ 48][ 44][ 42][