以下列车行驶日期均为109年1月1日1天，车种均为EMU。
顺行
区间车 3104次 嘉义→斗六
嘉 义 嘉 北 民 雄 大 林 石 龟 斗 南 斗 六
01:20 01:24 01:30 01:36 01:40 01:45 01:52
区间车 3108次 台南→嘉义
台 南 大 桥 永 康 新 市 南 科 善 化 拔 林 隆 田 林凤营 柳 营 新 营
01:30 01:34 01:39 01:45 01:50 01:54 01:58 02:02 02:07 02:11 02:16
后 壁 南 靖 水 上 嘉 义
02:22 02:28 02:31 02:37
区间车 3206次 高雄→台南
高 雄 三块厝 鼓 山 美术馆 内 惟 左 营 新左营 楠 梓 桥 头 冈 山 路 竹
01:00 01:03 01:06 01:09 01:11 01:13 01:17 01:22 01:26 01:31 01:37
大 湖 中 洲 仁 德 保 安 台 南
01:41 01:45 01:49 01:52 01:58
区间车 3214次 高雄→嘉义
高 雄 三块厝 鼓 山 美术馆 内 惟 左 营 新左营 楠 梓 桥 头 冈 山 路 竹
01:30 01:33 01:36 01:39 01:41 01:43 01:47 01:52 01:56 02:01 02:07
大 湖 中 洲 仁 德 保 安 台 南 大 桥 永 康 新 市 南 科 善 化 拔 林
02:11 02:15 02:19 02:22 02:29 02:32 02:36 02:42 02:47 02:52 02:56
隆 田 林凤营 柳 营 新 营 后 壁 南 靖 水 上 嘉 义
03:01 03:06 03:10 03:14 03:20 03:26 03:29 03:35
逆行
区间车 3317次 新左营→潮州
新左营 左 营 内 惟 美术馆 鼓 山 三块厝 高 雄 民 族 科工馆 正 义 凤 山
01:18 01:22 01:24 01:27 01:29 01:32 01:37 01:39 01:42 01:45 01:48
后 庄 九曲堂 六块厝 屏 东 归 来 麟 洛 西 势 竹 田 潮 州
01:52 01:57 02:02 02:06 02:09 02:12 02:16 02:20 02:25
区间车 3109次 台南→高雄
台 南 保 安 仁 德 中 洲 大 湖 路 竹 冈 山 桥 头 楠 梓 新左营 左 营
01:35 01:41 01:44 01:47 01:51 01:55 02:03 02:07 02:11 02:17 02:20
内 惟 美术馆 鼓 山 三块厝 高 雄
02:22 02:25 02:27 02:30 02:33
区间车 3103次 嘉义→台南
嘉 义 水 上 南 靖 后 壁 新 营 柳 营 林凤营 隆 田 拔 林 善 化 南 科
01:15 01:21 01:24 01:30 01:37 01:40 01:44 01:50 01:53 01:59 02:02
新 市 永 康 大 桥 台 南
02:07 02:13 02:17 02:20