[问题] Rmpi 安装请教 boshings PTT批踢踢实业坊

[问题] Rmpi 安装请教

楼主: boshings (bo) 2019-05-07 22:55:47

[问题类型]:
程式咨询
[软件熟悉度]:
入门
[问题描述]:
我想在用国网中心HPC主机执行平行运算，Rmpi一直无法安装成功。
尝试了几个环境模组仍然失败。
1) gcc/6.3.0 2) intel/2018_u1 3)openmpi/gcc/64/1.10.3
[程式范例]:
> install.packages("Rmpi")
Installing package into ‘
/home/u1/ee/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5’
(as ‘lib’ is unspecified)

作者: Wush978 (拒看低质媒体) 2019-05-07 23:09:00

安装 openmpi-devel

作者: celestialgod (å¤©) 2019-05-09 00:00:00

我用mpich2 安装成功，openmpi没成功过安装的时候记得要指定mpi type网络上google找的到相关教学(系统是用centos 7)PS: 用wget先抓下套件tar.gz 再用R CMD INSTALL我好像没用内建的install.packages成功过...

作者: clickhere (It's time to go home.) 2019-05-09 10:51:00

找出 mpi.h 和 libmpi.so 的 path用 R CMD INSTALL Rmpi*.tar.g --configure-args="--with-Rmpi-include=...path.to.mpi.h--with-Rmpi-libpath=...path.to.libmpi.so"Rmpi 里的 README 写得很清楚

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