[问题] 计算英文字串中 双字符的出现次数

楼主: Chihuah (灰色曼哈顿)   2018-12-10 13:00:22
[问题类型]:
效能咨询(我想让R 跑更快)
[软件熟悉度]:
入门(写过其他程式,只是对语法不熟悉)
[问题叙述]:
我想要统计一个英文字串中,双字母的出现次数,例如:
<input>
aabaaa
abbacazz
input aa ab ac ad ... az ba bb bc ... ca cb cc ... zz
aabaaa 3 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0
abbacazz 0 1 1 0 1 1 1 0 1 0 0 1
输入资料是一个csv档,内含一个字段<input>,每一笔(行)内容即为一个英文字串
输出资料是新增aa~zz共676个字段,
每一行的英文字串后,加入双字母的出现次数,未出现的为0次
下述程式码是我目前想到的,但是双循环执行mutate(程式第4~10行),过程速度很慢
想请教对于双字符的统计 是否有更好、执行效率更高的写法?
[程式范例]:
以下图片为程式码与注解
https://imgur.com/utlNEB7
以下为程式码原文
file_csv<- read.csv("test.csv",header=TRUE,sep=",")
n <- 1:nrow(file_csv)
patt <- NULL
for(i in 0:25){
for(j in 0:25){
tmp_2char <- paste(intToChar(97+i),intToChar(97+j),sep="")
patt <- c(patt,tmp_2char)
file_csv<-mutate(file_csv,!!tmp_2char:=0)
}
}
m <- length(patt)
for(x in n){
tmp_input <- tolower(as.character(file_csv$input[x]))
file_csv[x,2:(m+1)] <- str_count(tmp_input,patt)
}
[环境叙述]:
R version 3.5.1 (2018-07-02)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)
[关键字]:
mutate str_count 双字符出现次数
作者: andrew43 (讨厌有好心推文后删文者)   2018-12-10 13:39:00
参考看看。结构上也是双层(一个for一个sapply)。主要是靠 gregexpr() https://ideone.com/AKO8tG这应该不算快。10000个字串大概要16秒。
作者: x88776544pc (龙飞五丈原)   2018-12-10 14:07:00
先切字串再计数如何 https://ideone.com/0m24lP
作者: obarisk (OSWALT)   2018-12-10 19:16:00
nse的cost蛮大的
作者: celestialgod (天)   2018-12-10 23:33:00
https://pastebin.com/Der1EbFy 一万个大概6秒
楼主: Chihuah (灰色曼哈顿)   2018-12-13 12:26:00
感谢前面几位前辈的分享 获益良多~ 又学到一些技巧了

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