[问题] 分群和找位置相关问题

楼主: w32123 (Ru)   2018-10-31 18:11:22
[问题类型]:
程式咨询(我想用R 做某件事情,但是我不知道要怎么用R 写出来)
[软件熟悉度]:
入门(写过其他程式,只是对语法不熟悉)
[问题叙述]:
各位大神大家好~
http://i.imgur.com/tbduH5L.jpg
这个图中的每一小坨是植物的位置
是先对每个点的光谱值做kmeans分四群后找出来的
四个顶点是边界范围
我想找出散布在图中每一坨的中心点当作植物中心点
也想知道中心点的位置和个数
Hclust我只放入了x,y座标让他们分群可是感觉分不太出来QQ结果如图
http://i.imgur.com/mrC8b6c.jpg
想请问有除了分群以外的方法吗?
另外想让R自动决定分群数 有尝试过elbow method
但是都会出现Error: cannot allocate vector of size 91.4 Gb
不知道自动决定分群数有没有比较推荐的方法呢
先谢过各位大神了~
现有每个点的资料格式如图
最左边是序号 band1~4是光谱值 x,y是x,y座标
http://i.imgur.com/UUPYeCU.jpg
[程式范例]:
plant.cluster <- hclust(dist(remain.plant.add[,1:2]),method = "ward.D2")
png("hclust.png",res = 200,width = 2259,height = 1549)
plot(plant.cluster)
dev.off()
#elbow method
elbow.k <- function(mydata){
dist.obj <- dist(mydata)
hclust.obj <- hclust(dist.obj)
css.obj <- css.hclust(dist.obj,hclust.obj)
elbow.obj <- elbow.batch(css.obj)
k <- elbow.obj$k
return(k)
}
elbow.k(NDVI)
#Error: cannot allocate vector of size 91.4 Gb
[环境叙述]:
R version 3.5.0 (2018-04-23)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
[2] LC_CTYPE=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
[3] LC_MONETARY=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
[4] LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=Chinese (Traditional)_Taiwan.950
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods
[7] base
other attached packages:
[1] ggplot2_2.2.1 NbClust_3.0 rgdal_1.3-3 sp_1.3-1
loaded via a namespace (and not attached):
[1] Rcpp_0.12.18 lattice_0.20-35 crayon_1.3.4
[4] grid_3.5.0 plyr_1.8.4 gtable_0.2.0
[7] scales_1.0.0 pillar_1.3.0 rlang_0.2.2
[10] lazyeval_0.2.1 rstudioapi_0.7 labeling_0.3
[13] tools_3.5.0 munsell_0.5.0 compiler_3.5.0
[16] colorspace_1.3-2 tibble_1.4.2
[关键字]:
分群、中心点、位置
作者: Wush978 (拒看低质媒体)   2018-10-31 19:04:00
如果用别的分群算法呢? 例如 dbscan or supc
作者: andrew43 (讨厌有好心推文后删文者)   2018-10-31 20:21:00
看起来很均匀,这样硬要分群没什么意思。
作者: TreeMan (好啊...)   2018-10-31 20:29:00
自动决定分群数可以使用NbClust https://goo.gl/LwAtGx
作者: eric500g (鱼头)   2018-10-31 21:59:00
就图来看,是个平行四边形,每坨也差不多等距,何不直接算出大概的中心点?不知道理解有没有错
作者: andrew43 (讨厌有好心推文后删文者)   2018-11-01 10:13:00
光谱资料和座标资料有关吗?你实际想分析什么?
作者: Bourdieu1984   2018-11-09 07:29:00
试试fpc套件的pam函数

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