需要懂R的人帮忙解释一小段芯片微阵列程式码

楼主: waynecomm021 (waynecomm021)   2014-05-17 16:42:29
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问题
[问题类型]:程式咨询
意见调查(我对R 有个很棒的想法,想问问大家的意见)
程式咨询(我想用R 做某件事情,但是我不知道要怎么用R 写出来)
效能咨询(我想让R 跑更快)
经验咨询(我想用R 连接某些数据库,请问大家的经验)
程式咨询
[软件熟悉度]:入门
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新手(没写过程式,R 是我的第一次)
入门(写过其他程式,只是对语法不熟悉)
使用者(已经有用R 做过不少作品)
开发者(有撰写R 的套件经验)新手
[问题叙述]:由于不是很懂R,麻烦懂的人帮我解释一下最下面那段程式码(每一行的设计意义),芯片的位置在这边下载(http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/files/E-MEXP-569/E-MEXP-569.raw.1.zip)
请简略描述你所要做的事情,或是这个程式的目的
[程式范例]:source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
biocLite("affy")
biocLite("GeneNet")
biocLite("limma")
biocLite("tkWidgets")
biocLite("Biobase")
biocLite("AffyID2GeneID")
source("http://faculty.ucr.edu/~tgirke/Documents/R_BioCond/My_R_Scripts/GOHyperGAll.txt")
AffyID2GeneID(map =
"ftp://ftp.arabidopsis.org/home/tair/Microarrays/Affymetrix/affy_ATH1_array_elements-2010-12-20.txt")
library(affy)
library(limma)
library(tkWidgets)
library(annaffy)
library(GeneNet)
作者: andrew43 (讨厌有好心推文后删文者)   2014-05-17 17:20:00
征个一小时家教吧。
作者: yanchenglin (LIN)   2014-05-17 17:32:00
ggm.estimate.pcor network.test.edges extract.network 看这3个函数的help. 其他应该还好懂

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