这是我自己的经验(手机：红米3S)
首先我刷回最新的小米EU开发版ROM，确定可以执行0.37版PMGO游戏，
然后按照XDA上教学，先安装Magisk框架zip，与Magisk Manager App
https://goo.gl/edHGR3
然后刷phh's SuperUser。
到这一步就可以取得实际的root了，并且可以即时开关并玩PMGO，
有些人仅到这步就可以停了。
想要档广告也可以。
但是手机没Xposed怎么能用？
于是我需要topjohnwu的systemless xposed
http://forum.xda-developers.com/xposed/unofficial-systemless-xposed-t3388268
刷入并安装 Material Design Xposed Installer 后，
普通AOSP手机应该就有xposed框架了，
但是MIUI并不相容，我还需要MIUI专用的systemless xposed
https://goo.gl/LQIhI2
完成之后，
我实测在卸载root状态，可以玩PMGO没问题，
所有的xposed插件仍然能用(例如minminguard、绿色守护)
PMGO IV Checker插件也能用。
希望能帮到其他玩家。