薛瑞元出生于嘉义县，父亲是小学教师。他毕业于嘉义高中，之后进入台北医学院。[4]其
专业科目为妇产科，毕业后先是在台北市仁爱医院实习，而后返回嘉义开业。[4]当时一次
医疗纠纷促使他返回大学进修，38岁时以一类组榜首成绩考取台湾大学法律系，之后取得律
师执照、法律硕士学位。[3][4]