Re: [问题] 新手问题(已爬文)

楼主: xac420 (这是借口你应该懂吧)   2014-05-29 10:29:24
我已经有在资料夹里建立一个Theorem.R
然后用了以下这个
#!/bin/sh
#PBS -l walltime=9999:00:00
cd $PBS_O_WORKDIR
/opt/R-2.15.2/bin/R CMD BATCH Theorem.R
这时资料夹跑出一个Theorem.Rout
然后我又输入
qsub -l nodes=nodexx Theorem.sh
但他就跟我说
qsub: script file:: No such file or directory
接着我又试
qsub -l nodes=1 Theorem.sh
还是
qsub: script file:: No such file or directory
我完全不知道是该怎么做...可以请前辈救救我吗... T_T
感激不尽!!!
※ 引述《xac420 (Up to fate!)》之铭言:
: 各位前辈 老妹临时被老板要求使用cluster跑程式
: 我看网页弄了半天就是不会存shell file...
: 档案夹里有.R 因为我要跑R 可是我不知道怎么存.sh
: 完全没有头绪啊啊啊啊...希望有人可以教我一下>"<
: 谢谢!!!
楼主: xac420 (这是借口你应该懂吧)   2014-05-29 10:30:00
对了 我是用putty执行
作者: cocobox (钱盒子)   2014-05-29 10:52:00
qsub -l nodes=1 Theorem.R 这样?
楼主: xac420 (这是借口你应该懂吧)   2014-05-29 11:01:00
刚刚有试了 还是跟我说No such file or directory到底是怎么回事啊.....>"<
作者: jokester (蛮王科科)   2014-05-29 11:03:00
找附近的好人吧
作者: obarisk (OSWALT)   2014-05-29 11:04:00
qsub -l nodes=1 bash xxx.sh和qsub不熟chmod +x xxx.shqsub -l nodes=1 ./xxx.sh
楼主: xac420 (这是借口你应该懂吧)   2014-05-29 11:15:00
obarisk同学 我刚刚用qsub -l nodes=1 bash xxx.sh 然后跑出一堆东西..但我还是不知道我做对做错...要死了!!
作者: wyvernlee (wyvernlee)   2014-05-29 20:40:00
原 po 最近真忙,一下子问 LaTeX,一下子问 Linux ..有没有考虑换个领域比较相近的老板比较好过 ? XD
作者: mike7689 (帅啊~!老皮~!!)   2014-05-29 20:42:00
如果你在北部可以找我,我大概知道你的问题但懒得线上解迷我在119...如果你靠近木栅附近更好XDps. 我是作计算物理的,目前用latex写硕论
作者: suzuke (suzuke)   2014-05-30 00:17:00
qsub是个排程工具, 你要不要先去翻一翻文件?简单来说qsub xxx.sh是要将xxx.sh这支script(程式)送给qsub来排程, 等到有空的node就会在那个node上执行xxx.sh里面的指令, qsub还有一堆参数可以下, 这就要去翻文件了我已经毕业有一阵子了, 所以记忆不太清楚, 参数的部份我无法帮你QQ
楼主: xac420 (这是借口你应该懂吧)   2014-05-30 09:43:00
wyvernlee 哀呀被你发现!可是我很喜欢我老板诶XD 不想换~mike7689 请问119是?消防队?我在台北..私下找你谢谢!suzuke 对!!我就是要等node帮我执行我存的.sh
作者: soem (流水)   2014-05-31 12:54:00
应该是指140.119的样子

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