小弟不才，字音字形刚好是专长领域，
96、97年曾忝为高雄县字音字形高中组第一名，
稍微补充一点资讯。
以文字学角度来看，
《说文解字‧土部》：“堀：兔堀也。从土屈声。”
以声韵学角度来看，
《宋本广韵》、《集韵》、《正韵》皆作苦骨切。
P.S. 简单讲一下，苦的注音是ㄎㄨˇ，骨的注音是ㄍㄨˇ，
苦骨切就是ㄎㄨˇ、ㄍㄨˇ这样拼音，
类似现代的注音符号，古代人学读音大概是这么学的，
但声韵学有很多艰难复杂的部分，这里不谈。
(P.S. 声韵学是念中文系的人一致公认的大魔王，我自己也学不太好XD)
按照K大也补充过的教育部颁订的异体字典的资讯来检视，
堀：同“窟”，洞穴的意思，只有ㄎㄨ的读音，
因此大阪的道顿堀、丰臣三中老之一的堀尾吉晴、织田家家臣堀秀政，都要念ㄎㄨ。
如同众板友推文所言，这是一个积非成是的结果。
但是却有个例外，宋玉的《风赋》：“堀堁扬尘”，这里的“堀”当动词用，通“掘”。
如果以这个例外来说明的话，“堀”要念成ㄐㄩㄝˊ的先决要件必须是动词，但依照
古书上的普遍解释，ㄎㄨ仍应当作正确读音，宋玉的这个例子可能也只是他的一家之言，
因而，新堀江的正确念法仍应作ㄎㄨ。
我不知道教育部最新颁订的读音是否有作更动，这点还请板上强者指正补充。
我们生活周遭也不乏积非成是的例子，如：
西门“町”原本读音是ㄊㄧㄥˇ，但大家都念ㄉㄧㄥ，教育部索性就改成两个读音皆对；
“癌”症原本读音是ㄧㄢˊ，后来也变成ㄞˊ也通用。
其他还有“一味”、“一昧”不分；“养生”、“养身”不分；“在”、“再”不分等，
尤其是一味这个，非常受不了一直讲成一昧...。
因为要搭第一班高铁上台北出差，早点起床就顺道补充了XD