马英九执政期间，中研院院长遴选也曾争议多时。
为此联合报曾收集各院士意见，其中赞成退回的意见：
赞成01：管中闵
院长遴选既然产生重大争议，甚至造成一位候选人愤而弃选。此时即使总统圈选，
被选中者难昭大信，亦难以服众。最上策是名单上其他两位也自动弃选，使评议会
必须重新遴选。如不能做到，只好请总统退回。
※ 引述《vic2211 (我是vic)》之铭言：
: 自由
: 管中闵被爆中国学校违法兼职 厦门大学：确实在此授课
: http://news.ltn.com.tw/news/life/breakingnews/2367345
: 2018-03-16 13:32
: 〔记者吴柏轩、林晓云／台北报导〕台湾大学校长当选人管中闵被踢爆，涉赴中国厦门大
: 学等学校长期违法兼职，时间从2005年起，包含管中闵个人自介、中国网站介绍等，且厦
: 大王亚南经济研究院也证实，管中闵确实在此授课，并从研究院创始就在，“今年应也会
: 跟往年一般。”
: 根据爆料者提供，厦门大学的国际学生招生网显示，2018年提供英文授课专业，文案强调
: 很多教授在海外取得博士学位，可用英语指导博士生，并提供相关学院与博士生导师名册
: ，而管中闵就被列入厦大的王亚南经济研究院（WISE）师资阵容中，涉嫌违法兼职。
: 爆料者更说，在网上可查的部分资讯，如该研究院2008及2011两份招生简章中，明确将管
: 列为师资，并担任兼职，多份网络资料显示，管中闵都被该研究院聘为兼职教师，并担负
: “博士生导师”一职，且在厦门大学英文授课博士专业导师名录中，管中闵就列为数量经
: 济学及金融学的师资阵容中，另外一份管中闵的英文版个人介绍中，更描述从2005年4月
: 起就担任厦门大学兼职，且2006年10月去华中科技大学、2007年6月去西安交通大学等，
: 可见其赴中国各大学兼职的“经历”十分丰富。
: 而经访厦大王亚南经济研究院的人员，蔡姓人员表示，管中闵从研究院创院之初就已加入
: ，并确实开班授课，有负责国际学生的金融博士学位等，每年约来2、3次，1次约待1个月
: ，因此授课较集中，至于授课日期则不固定，需视管的行程安排，但今年应该会照往年一
: 般，展开授课。
: 而中国对台31项政策日前引发效应，教育部长潘文忠便在立法院提醒，公立大专校院专职
: 教师去兼职须注意，不料管中闵却被踢爆长期赴中国兼职，已有台大教授质疑，管的中国
: 兼职是否报备、有无违法等，呼吁教育部、中研院乃至相关部会都要详查。
: 依教育部教育人员任用条例、公立学校专任教师兼职处理原则、两岸人民关系条例等法规
: ，加上98年针对教育人员赴中国交流的函释，都明白规定，“现行与大陆地区公立学校交
: 流政策，关于‘研究、教学人员交流’部分仅限于一般交流常态之短期客座讲学，请勿涉
: 及聘任我方人员担任教职或研究职务事宜。”因此，现行并未同意教师得赴大陆地区学校
: 兼职或兼课。
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