<背景>
到了22世纪以后 开始进行地球轨道开发计划
在拉格朗日点建立起人造卫星基地、Land 1与Land 2的巨大殖民地作为地球的移民之用
从此地球人开始了移居。
在这些3座殖民地附近有作为资材调度的小行星群“vesta”被称为"Isis星团"，
此后持续数十年之间繁荣。
可是，在Land 2突然发生生化危机，居民出现大量的牺牲而呈现毁灭的的状态，而生物研
究的シュトルテ博士也失踪了。同时Isis星团的最高负责人プレシデントファイブ(五大老)中的オレギ、
レデスマ、ウェーバー3人发动政变，放逐同事的トーゴ，并幽闭了タニア议长。
此后3人自称为bionoid 3将军，组成bio军。
这背后有个被称为bio凯萨的生物存在，策划著对Land 1的侵占。
独自逃跑トーゴ，跟残存的人们呼吁向bio军进行彻底抗战。
发现事态严重的地球方，数次派遣调查队到Land 1。但是，第1次调查队到达后，就是失
去消息。此后由机器人部队组成的第2次调查队到达，继续主人公ジン所属第3次调查队也出发了。当第3次
调查队的宇宙艇到达时Land 1，宇宙艇被机器兵军团袭击……。
ラグランジュポイント