直球回答你的问题：
参考工程会：https://www.pcc.gov.tw/cp.aspx?n=99E24DAAC84279E4
第42点：工程结算验收证明书作业流程及填报说明中的二.(三)略以...
“结算总价”之计算方式为
“契约金额”加“增加金额”减“减少金额”减“验收扣款”。
竣工书图上的结算金额只能称作“契约金额”加“增加金额”减“减少金额”的部分，
所以“结算总价”应扣除验收扣款，于文有据。
※ 引述《kiba ( )》之铭言：
: 依据中央政府各机关工程管理费支用要点
: 工程管理费以各该工程之结算总价为计算标准。但不包括补偿费、购
: 地费、迁移费、水电外线补助费、营业税、规费、法律费、承包商办
: 理工程之各项利息、保险费及规划设计监造酬金等。
: 所以通常计算会结算价扣掉保险&税捐再乘相关比率
: 那请问 验收扣款需要也扣掉吗 ?
: 现在假如我结算明细表上是100万
: 验收证明书上因为有扣款 所以变95万
: 要用哪个去计算管理费 ?
: 现在会计单位换算认知不同 多花了85元 硬是要我拿掉一笔 囧
: 早知道不要花那么接近了 XD