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8/20补充：
发现我把经纬度四舍五入进错方向，
所以不小心把台湾北部(大概台北市立动物园以北)忽略掉了，
少了天龙国怎么还可以称全台呢，差点标题就只能打中南部了，
所以只好连夜重头修改，加上一点台北的资料 :)
我原本就只想列最大的主要巢穴，所以前两个提到的是数量最多的大巢穴，
之后的小巢穴就照心情列几个，然后顺序也乱排，因为小巢穴数量很多，
无法一一列出来，所以会有很多漏网之鱼请别见怪。
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大家都知道宝可梦是有巢穴的，有些宝可梦在某个地点特别多，
经过三四天的分析，整理出一些台湾本岛宝可梦比较大的巢穴。
当然只能当参考，数量多可能是因为游客多，发现的数量高，不代表出现率也高。
也许还有很多地点也是宝可梦的巢穴，但因为游客较少，样本数量少，所以没被列出来。
介绍顺序请参考上一篇的稀有度排名： http://i.imgur.com/OrMJ5vB.png
本篇主要只介绍A级和B级的宝可梦，C~E级的宝可梦到处都有，不想遇到都难。
很多C~E级的宝可梦数量最多的地点都是在台北和台中，但应该只是那里游客多罢了。
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本文提到的{热门风景区}指的是热门景点，例如以下地点(版上已经有很多心得)：
新竹南寮渔港和风力活动公园附近、
台中清水梧栖渔港和海滨公园附近、
高雄旗津风车公园、
台南安平的观夕平台 & 台江国家公园 & 渔光岛上长长的海堤、
台南南鲲鯓代天府、
嘉义东石渔人码头、
花莲七星潭海滨公园、
澎湖...等。
此外还有很多风景区都属于这类，不胜枚举，可以参考推文或其他文章的心得。
如果你发现有一个地方，各种怪都抓的到，不用太惊讶，
表示那个地点应该也是一个{热门风景区}，几乎每种宝可梦都能在{热门风景区}遇到，
所以下面就算没列出来，也请自行帮每种宝可梦的巢穴都加上{热门风景区}。
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007 Squirtle(杰尼龟)
几乎到处都有，台北青年公园是全台最多杰尼龟的地方。
072 Tentacool(玛瑙水母)
几乎到处都有，港口一大堆，尤其是高雄港、台南安平港、台北花博公园新生园区。
035 Clefairy(皮皮)
几乎到处都有，尤其山上常会遇到。
147 Dratini(迷你龙)
几乎到处都有，有水的地方几乎都有，没什么特别突出的龙穴。
例如以高雄为例，分布图大概长这样：
http://i.imgur.com/Z8C5r5Z.png
114 Tangela(蔓藤怪)
似乎到处都有，没有特别主要的大巢穴。
092 Gastly(鬼斯)
到处都有，屏东市中山公园最多。
高雄楠梓右昌森林公园、新北水源景观运动公园...等公园也常出现。
084 Doduo(嘟嘟)
到处都有。台南水萍塭公园最多。
052 Meowth(喵喵)
台中国立自然科学博物馆是喵喵的大巢穴。
台中的英才公园、彰化员林公园也很多。
{热门风景区}偶尔也会遇到。
有人说台中葫芦墩公园也有。
063 Abra(凯西)
台北新庄运动公园是凯西最多的地方。
其次是高雄文化中心、新北仁爱公园。
高雄三民亲子公园和新客家文化园区之间、高雄小港区高雄公园、
高雄哈玛星铁道文化园区、台中公馆公园、桃园朝阳森林公园、嘉义市立体育馆。
004 Charmander(小火龙)
台南可说是小火龙的故乡，到处是小火龙的龙穴。
几乎一半的小火龙都在台南，常见的点有：
远东科技大学、新市夜市、善化区公所附近、梦湖、善化区文康育乐中心...等。
高雄的高雄师范大学和平校区、新北土城国民运动中心。
027 Sandshrew(穿山鼠)
{热门风景区}最多，其次是高雄大东文化艺术中心。
074 Geodude(小拳石)
台南国立台湾历史博物馆、台东森林公园、
{热门风景区}
039 Jigglypuff(胖丁)
高雄中央公园是最多胖丁的地方。
台中草悟广场也常有胖丁出没。
123 Scyther(飞天螳螂)
到处都有，高雄原生植物园和台南文化中心最多。
037 Vulpix(六尾)
几乎都集中在台中，常见的点有：
台中国立台湾美术馆、台中圆满户外剧场、台中八二三纪念公园、台中台中大里运动公园
高雄冈山河堤公园、桃园中坜旧社公园，偶尔也遇的到。
081 Magnemite(小磁怪)
{热门风景区}最多。
彰化台湾玻璃馆、台中丰乐雕塑公园、台中北区中正公园、台中旧社公园、
台中市南屯区岭东路750号的篮球场、新北秀朗清溪河滨公园+小碧潭公园。
111 Rhyhorn(独角犀牛)
高雄河堤公园最多。
高雄都会公园、高雄凤山地方文化馆、新北三重的中山艺术公园、{热门风景区}。
058 Growlithe(卡蒂狗)
高雄盐埕区公园二路旁的盐埕绿廊最多。
台北前港公园、台中逢甲大学育乐馆前、台中北区忠太东路和忠太西路、台中仁爱公园、
高雄市水情中心、{热门风景区}
077 Ponyta(小火马)
{热门风景区}、高雄梦时代前的停车场、新北大汉溪两岸的河滨公园。
083 Farfetch'd(大葱鸭)
台北市立图书馆北投分馆最多大葱鸭。
高雄莲池潭南方池边、台中夏绿地公园、台中忠明公园、台北玉成公园。
109 Koffing(瓦斯弹)
数量好像不多，分布很平均，没特别突出的地点。
台南成大榕园偶尔出现，但可能不多。
104 Cubone(卡拉卡拉)
台北碧湖公园最多。
{热门风景区}。
025 Pikachu(皮卡丘)
台南是最多皮卡丘的地方，光是小东公园和台南市立后甲国中这一带，几乎占了两成。
台中的沙鹿公园、逢甲公园、公益路和忠明南路相交的公园、景福公园、滨海公园。
彰化延平公园、新北捷运芦洲站、台北国父纪念馆、台北久康公园、台北信义广场、
云林人文公园、高雄旗山糖厂前、高雄汉民夜市、桃园中坜的新兴公园、{热门风景区}。
126 Magmar(鸭嘴火兽)
新北阳光运动公园最多，近两成的鸭嘴火兽都在这。
宜兰罗东林业文化园区也常有，可能有8.7%都在这。
台南成大榕园、台中馆前路和中兴街中间、台中望高寮夜景公园、台中大智公园、
高雄澄清湖高尔夫俱乐部。
100 Voltorb(霹雳电球)
{热门风景区}、彰化台湾玻璃博物馆。
095 Onix(大岩蛇)
高雄市立美术馆非常多，几乎四成的大岩蛇都在这。
台北大湖公园、新竹十八尖山、台南三角公园、桃园三民运动公园。
090 Shellder(大舌贝)
{热门风景区}。
096 Drowzee(催眠貘 素利普)
高雄劳工公园和嘉义文化公园最多。
台北花博公园圆山园区、桃园八德埤塘生态公园、台东加路兰游憩区、新北竹林山寺公园
{热门风景区}。
066 Machop(腕力)
桃园艺文广场和高雄前镇的中钢总部大楼最多。
{热门风景区}
台南的中华民国内政部移民署、国立台南高工、台中小来公园。
050 Diglett(地鼠)
新北三重集贤环保公园、天母天母运动公园、台南亿载金城。
{热门风景区}、台中市南区国立公共资讯图书馆前的森林、
高雄捷运凹子底站、高雄前镇岗山仔公园。
056 Mankey(猴怪)
新北市锦和运动公园和新北黄城公园最多。
{热门风景区}、高雄冈山中山公园、屏东复兴公园、国立台中教育大学、
新竹东门城(迎曦门)南方河边、桃园大溪木艺生态博物馆壹号馆、台中滨海公园、
台南市西港区附近。
088 Grimer(臭泥)
数量不多，分布平均。
086 Seel(小海狮)
{热门风景区}(尤其是南寮)、桃园中坜艺术园区、桃园中坜坤庆公园...偶尔会遇到。
125 Electabuzz(电击兽)
嘉义公园+孔庙+射日塔 非常多，几乎四成的电击兽都在这。
桃园延平公园、台中二二八纪念公园(东峰公园)、高雄大东公园...也有。
124 Jynx(迷唇姐)
高雄爱河旁的河西路非常多，几乎四成的迷唇姐都在这。
台中和平里921地震公园、台中万寿棒球场、南投光华公园、
台中东兴公园、台中甘肃公园...偶尔也有。
138 Omanyte(菊石兽)、140 Kabuto(化石盔)
样本数不多无法分析，似乎随机分布。
143 Snorlax(卡比兽)、108 Lickitung(大舌头)、137 Porygon(多边兽 3D龙)、
131 Lapras(拉普拉斯 乘龙)、113 Chansey(吉利蛋)、
106 Hitmonlee(飞腿郎)、107 Hitmonchan(快拳郎)
数量稀少，似乎随机分布。
欢迎大家指证和补充 :)